太阳能辐射到地球上以后，被绿色植物吸收和固定，这个过程就是&1dquo;光合作用”。在光合作用过程中，绿色植物在光能的作用下，把吸收的二氧化碳和水，合成为碳水化台物，称为&1squo;光合产物”。同时也把吸收的光能固定在光合产物分子的化学健上，这种贮藏起来的化学能，一方面满足植物自身的生命活动的需要，同时也供给其它异养生物生活的需要。于是，太阳能通过绿色植物的&1dquo;光合作用”进入了生态系统。并作为高效的化学能，开始了流动。例如作为饲料的牧草，含有一定的淀粉、脂肪、蛋白质、纤维素等有机质，亦即含有动物，当草食动物被肉食动物捕食后，能量又流入了肉食动物，人类又以植物、动物为食，能量于是又流入了人类生命体中。
生态系统中这种能沿着各个营养级位的流动就是能量流。能量流是生态系统的基本特性，也是基本功能。
生态农业系统中的能量流动，实际上是把太阳能转化为产品的过程，这种转化效率的高低，取决系统的结构与功能。因此，通过系统能量流的计算分析，通过在能量流分析基础上的生态效率计算，就可以发现系统结构是否合理，发现生产过程中的某一薄弱环节。从而提出改进措施。例如，某一生态农业系统总的生态效率不高，通过分析可以找出是种植业或是养殖业的效率影响整个系统。若是养殖业的效率低下，那么分析是猪场还是鸡场的效率制约养殖业的效率，这样通过层层剖析，就能找出影响、制约整个系统生态效率、生产力提高的薄弱环节，为改善提高系统效率和功能提供了依据。而这些都必须是在系统能量流分析基础上进行的。
因此，系统能量流的分析研究，是提高系统功能，管好，用好，建设好生态农业系统的关键条件之一。
